A városban 15 S-Bahn, 9 U-Bahn, 22 villamos, kb. 150 autóbuszvonal üzemel. Berlin központi pályaudvara a Berlin Hauptbahnhof. Nagy forgalmú és központi fekvésű a Berlin - Zoologischer Garten (Zoo) pályaudvar is, amely számos U-Bahn és buszvonal találkozása. A "városnéző" 100-as és 200-as autóbusz-járatoknak ez a végállomása. A város felfedezésére érdemes a sűrű, kényelmes és gyors tömegközlekedést választani, a napijeggyel korlátlan számú átszállást lehet olcsón megvásárolni. A Zoo-nál a helyi közlekedési vállalat (BVG) irodájában hálózati térkép és ismertetők is kaphatók, az alapvető információk térítésmentesen. Berlinben és környékén közlekedési szövetség van, ezért a regionális vonatokra is fel lehet szállni. Ezek a várost 20-30 perc alatt átszelik, illetve elmennek a közeli településekre.

A város közlekedését elősegíti az A100-as számú városi autópálya is. Budapesttől eltérően a legnagyobb kereszteződésekben is lehet balra kanyarodni, amely a szembejövő forgalom és a város keleti felén a villamosforgalom ellenére működik. A város körül fut az A 10-es autópálya.

Az A 111-es autópálya északnyugat felé halad Hamburg és Rostock irányába. Az A 113-as délkeletre Drezdába és Cottbusba. Azonban ez még nem készült el teljes mértékben. Az A 115-ös autópálya Hannoverrel és Lipcsével köti össze Berlint. Az egész város körülöleli a Berlin Ring.